当选为新成立的中华全国科学技术普及协会常务委员 ，负责组建协会秘书处；并以中国***全国科联 、科普联合支部书记的名义
，协助推动中华全国自然科学专门学会联合会秘书处的工作
。四五年间，他奔波于全国 ，先后推动了20几个省市的科联
、科普分会的建立。

1955年10月
，朱兆祥作为中国科学院代表赴深圳欢迎留美著名科学家钱学森回国 。接着，朱兆祥协助钱学森和钱伟长筹建中国科学院力学研究所并筹组中国力学学会。正当他努力为新建的力学研究所做好学术管理工作、积极发展力学研究业务之际 ，“反右派”运动开始了
，朱兆祥被指控为包庇右派，蒙受不白之冤而受到沉重打击
。他被调到新成立的中国科学技术大学任教。在这充满着辛酸和苦楚的坎坷之路上 ，他又在力学教学和新学科的创建上倾注了心血，不断地开拓 。他在中国科学技术大学地球物理系和近代力学系任教的20几年中
，先后开出10余门课程
。

从1963年起，朱兆祥主持近代力学系爆炸力学教研室的工作 ，领导了我国第一个爆炸力学专业的工作
，使其健康地发展。20多年来他从教师科研队伍的形成和提高 、教材建设
、实验室建设，以及本科生和研究生的培养等各个方面 ，为爆炸力学和冲击动力学的发展作出了重要贡献 。与此同时
，他从事空中核爆炸、应力波的传播及其引起的损伤和屈曲 、材料冲击性能，以及力学史等方面的研究
。 在中国科技大学 ，建立和发展